More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1101 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  100 
 
 		 463 aa  927    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  67.82 
 
 		 481 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  68.25 
 
 		 486 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  68.03 
 
 		 463 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.47 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.69 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.91 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.69 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.7 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.47 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.7 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.7 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  47.7 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.03 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  47.92 
 
 		 484 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  45.95 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.48 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.48 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  48.15 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  48.12 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.16 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.7 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.6 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.45 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.85 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.1 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  42.89 
 
 		 461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.15 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.45 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.61 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.61 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.74 
 
 		 471 aa  346  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.38 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.88 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.19 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.31 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.89 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  40.44 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.38 
 
 		 458 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.93 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.93 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.61 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  41.18 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.39 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  40.73 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.58 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.34 
 
 		 442 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.22 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.74 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.23 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  39.95 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.44 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  35.99 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.31 
 
 		 472 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.45 
 
 		 444 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.78 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.23 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.07 
 
 		 480 aa  289  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.43 
 
 		 471 aa  283  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.4 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.62 
 
 		 674 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.79 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.97 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.94 
 
 		 437 aa  250  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.78 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.32 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  35.08 
 
 		 395 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.7 
 
 		 439 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  35.31 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.94 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.39 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.16 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.39 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  34.79 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  35.39 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.16 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.39 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  34.55 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  34.55 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.49 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.2 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.2 
 
 		 394 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.48 
 
 		 428 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.49 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.2 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.69 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.2 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.03 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  31.86 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.41 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.47 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.3 
 
 		 518 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.33 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  30.5 
 
 		 390 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.35 
 
 		 390 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  31.5 
 
 		 358 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.42 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  30.56 
 
 		 442 aa  187  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.32 
 
 		 403 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.34 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>