More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0636 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  100 
 
 
674 aa  1374    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  56.45 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  55.7 
 
 
448 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  55.26 
 
 
446 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  52.12 
 
 
442 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  49.89 
 
 
447 aa  439  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.21 
 
 
453 aa  327  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.38 
 
 
453 aa  326  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.89 
 
 
451 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.85 
 
 
452 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.5 
 
 
474 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.27 
 
 
453 aa  320  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.29 
 
 
474 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.77 
 
 
455 aa  317  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  43.53 
 
 
378 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.99 
 
 
458 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  43.06 
 
 
378 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.09 
 
 
443 aa  313  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  38.8 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.36 
 
 
487 aa  307  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.99 
 
 
458 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.99 
 
 
458 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.99 
 
 
458 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.58 
 
 
440 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.45 
 
 
480 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  39.96 
 
 
481 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  40.69 
 
 
461 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.36 
 
 
473 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.53 
 
 
471 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.79 
 
 
433 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.04 
 
 
444 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.91 
 
 
471 aa  286  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.36 
 
 
439 aa  286  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.78 
 
 
430 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  36.29 
 
 
463 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.92 
 
 
471 aa  278  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.84 
 
 
468 aa  277  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  37.23 
 
 
463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.92 
 
 
460 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.84 
 
 
460 aa  273  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  34.03 
 
 
460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  37.01 
 
 
486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  34.92 
 
 
460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.42 
 
 
460 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.42 
 
 
460 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
460 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
460 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
460 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 
460 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.6 
 
 
472 aa  266  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.11 
 
 
460 aa  266  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.06 
 
 
460 aa  266  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  33.55 
 
 
484 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.1 
 
 
460 aa  264  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.87 
 
 
416 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.45 
 
 
472 aa  260  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.49 
 
 
460 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.26 
 
 
460 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  33.2 
 
 
455 aa  257  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.64 
 
 
395 aa  258  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.19 
 
 
430 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
468 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.29 
 
 
474 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.92 
 
 
439 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  35.84 
 
 
475 aa  251  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  37.44 
 
 
391 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.09 
 
 
421 aa  244  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  36.44 
 
 
395 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  36 
 
 
395 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.87 
 
 
468 aa  234  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.78 
 
 
389 aa  231  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.26 
 
 
399 aa  230  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.25 
 
 
389 aa  230  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.42 
 
 
399 aa  228  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  31.99 
 
 
471 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  31.99 
 
 
469 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.76 
 
 
396 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.76 
 
 
396 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.51 
 
 
410 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  35.54 
 
 
396 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.54 
 
 
396 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.54 
 
 
396 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.74 
 
 
394 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.1 
 
 
428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.33 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.42 
 
 
437 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.8 
 
 
389 aa  213  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.48 
 
 
424 aa  213  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.77 
 
 
394 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.25 
 
 
394 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.01 
 
 
394 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.97 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.45 
 
 
389 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.14 
 
 
518 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  33.19 
 
 
439 aa  196  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  34.99 
 
 
358 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  31.57 
 
 
389 aa  189  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
390 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.44 
 
 
480 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.39 
 
 
447 aa  177  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>