More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2986 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
443 aa  902    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.29 
 
 
443 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.31 
 
 
458 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.98 
 
 
442 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.12 
 
 
455 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.06 
 
 
466 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.09 
 
 
458 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.59 
 
 
458 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.38 
 
 
458 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.26 
 
 
447 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.84 
 
 
440 aa  193  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.68 
 
 
453 aa  193  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.03 
 
 
453 aa  193  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.95 
 
 
453 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.58 
 
 
474 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.75 
 
 
452 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.7 
 
 
473 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.17 
 
 
455 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.34 
 
 
474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  30.07 
 
 
378 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  29.02 
 
 
378 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.43 
 
 
444 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  28.47 
 
 
488 aa  189  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  28.38 
 
 
481 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  28.74 
 
 
471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  28.74 
 
 
469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.4 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.15 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.96 
 
 
487 aa  183  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 
468 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.18 
 
 
451 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.7 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  28.15 
 
 
463 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.19 
 
 
439 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  29.75 
 
 
461 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  27.88 
 
 
460 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  29.27 
 
 
486 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.67 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  29.44 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.5 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.25 
 
 
674 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.21 
 
 
471 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.78 
 
 
433 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.38 
 
 
460 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.06 
 
 
430 aa  170  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.2 
 
 
399 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.63 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.61 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  30.42 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.93 
 
 
460 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.49 
 
 
460 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.49 
 
 
460 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  26.61 
 
 
460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.07 
 
 
518 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.47 
 
 
471 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.69 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.12 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.42 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.62 
 
 
460 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.62 
 
 
460 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.75 
 
 
492 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.62 
 
 
460 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.62 
 
 
460 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.38 
 
 
480 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.71 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.71 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  28.77 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.77 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  24.84 
 
 
484 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.48 
 
 
416 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.78 
 
 
474 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  25.68 
 
 
463 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  29.1 
 
 
475 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.81 
 
 
396 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.19 
 
 
472 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  28.64 
 
 
390 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.4 
 
 
460 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.28 
 
 
394 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.76 
 
 
458 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.58 
 
 
438 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.53 
 
 
394 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.24 
 
 
395 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.79 
 
 
394 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.79 
 
 
481 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.31 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.49 
 
 
460 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.28 
 
 
394 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.33 
 
 
421 aa  155  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.17 
 
 
410 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.25 
 
 
439 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  27.7 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.77 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.33 
 
 
390 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.84 
 
 
430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.33 
 
 
447 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.27 
 
 
447 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.68 
 
 
505 aa  152  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>