More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2078 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 458 aa  907    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  56.54 
 
 		 438 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.11 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.09 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.46 
 
 		 474 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.46 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  34.45 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.39 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.28 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.74 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.15 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.43 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  27.84 
 
 		 488 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.89 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.73 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.85 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.24 
 
 		 487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.34 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.25 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.51 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.2 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.73 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.05 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.71 
 
 		 443 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  29.07 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.97 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.73 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.73 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.64 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.13 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.55 
 
 		 430 aa  183  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  28.17 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.73 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.27 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.79 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.44 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.09 
 
 		 430 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.95 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.25 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  28.01 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  27.15 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  27.67 
 
 		 463 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.6 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.6 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.6 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.6 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.02 
 
 		 674 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  31.89 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.5 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  27.68 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.25 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.25 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.07 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.68 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  28.3 
 
 		 378 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.02 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  29.88 
 
 		 469 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  29.65 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  26.32 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.19 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  27.82 
 
 		 378 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.09 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.06 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.43 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.12 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.08 
 
 		 416 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.37 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.86 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.76 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.1 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  27.13 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.8 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.38 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.76 
 
 		 390 aa  156  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.73 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.98 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  27.95 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  31.63 
 
 		 661 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.48 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.54 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.19 
 
 		 441 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  27.79 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.01 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  29.13 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.19 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  26.22 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  30.14 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.23 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  29.93 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.66 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.65 
 
 		 472 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.88 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.55 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  33.18 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.99 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.11 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.95 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>