More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3566 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  100 
 
 
463 aa  947    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  78.04 
 
 
488 aa  742    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  55.6 
 
 
479 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1897  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.27 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000214805  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.5 
 
 
480 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 
480 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.6 
 
 
448 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  31.32 
 
 
456 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.72 
 
 
449 aa  219  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.11 
 
 
468 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 
472 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27 
 
 
481 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.69 
 
 
466 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.07 
 
 
514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.84 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.54 
 
 
456 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 
456 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.39 
 
 
511 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.87 
 
 
453 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.06 
 
 
430 aa  131  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.7 
 
 
458 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.64 
 
 
438 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.27 
 
 
460 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  25.48 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.72 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.19 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.19 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.46 
 
 
457 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.81 
 
 
466 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.79 
 
 
448 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.64 
 
 
480 aa  126  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  25.76 
 
 
484 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.27 
 
 
460 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 
451 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.32 
 
 
460 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.73 
 
 
465 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.73 
 
 
465 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.29 
 
 
473 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.51 
 
 
444 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  25.38 
 
 
439 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.2 
 
 
458 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.11 
 
 
460 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.11 
 
 
460 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  24.69 
 
 
463 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.89 
 
 
460 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.45 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.2 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.2 
 
 
458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.73 
 
 
491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  24.64 
 
 
463 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.49 
 
 
473 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.88 
 
 
399 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  23.85 
 
 
460 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25.71 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.23 
 
 
460 aa  120  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  23.28 
 
 
486 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.35 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.18 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.03 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.03 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.03 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.03 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  23.82 
 
 
481 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.27 
 
 
453 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.05 
 
 
433 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.67 
 
 
455 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.59 
 
 
460 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.3 
 
 
394 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.95 
 
 
444 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.68 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.64 
 
 
446 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.05 
 
 
399 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.01 
 
 
475 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  25.06 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.59 
 
 
474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.22 
 
 
441 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.81 
 
 
403 aa  113  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.37 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.53 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.05 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.03 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.54 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  27.03 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.03 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.03 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.03 
 
 
396 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.99 
 
 
442 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.2 
 
 
674 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27 
 
 
394 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.98 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.43 
 
 
473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  27.47 
 
 
473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4071  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 
432 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000586904  normal  0.188824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.15 
 
 
439 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.59 
 
 
378 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.31 
 
 
460 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7361  membrane-fusion protein  27.97 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>