More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1897 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1897  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
476 aa  952    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.3 
 
 
488 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.63 
 
 
479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.43 
 
 
463 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.83 
 
 
477 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.5 
 
 
480 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.15 
 
 
480 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.81 
 
 
448 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.26 
 
 
449 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  32.13 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  27.02 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.91 
 
 
473 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.13 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.92 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.05 
 
 
468 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.19 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.15 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.19 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  24.34 
 
 
441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  27.15 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.22 
 
 
466 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.06 
 
 
444 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.05 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.96 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  25.12 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.11 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  26.56 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.56 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 
468 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.57 
 
 
475 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.45 
 
 
430 aa  118  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.11 
 
 
453 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.07 
 
 
416 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.37 
 
 
453 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4071  secretion protein HlyD family protein  28.64 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000586904  normal  0.188824 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  24.28 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.36 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.51 
 
 
469 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7361  membrane-fusion protein  28.41 
 
 
432 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.8 
 
 
451 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  22.81 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  24.26 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.68 
 
 
451 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.54 
 
 
514 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.33 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.12 
 
 
455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.81 
 
 
458 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.69 
 
 
458 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  26.42 
 
 
469 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.43 
 
 
481 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.69 
 
 
458 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.46 
 
 
458 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  26.42 
 
 
471 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.33 
 
 
428 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.22 
 
 
447 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.12 
 
 
410 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.14 
 
 
441 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.27 
 
 
474 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.89 
 
 
453 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.27 
 
 
474 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  25.21 
 
 
472 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25 
 
 
404 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.21 
 
 
491 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  24.88 
 
 
467 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.03 
 
 
441 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.8 
 
 
455 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.12 
 
 
439 aa  103  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.69 
 
 
471 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.6 
 
 
447 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.94 
 
 
439 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.17 
 
 
447 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.67 
 
 
442 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.29 
 
 
474 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  27.11 
 
 
447 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.31 
 
 
446 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.9 
 
 
442 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.64 
 
 
518 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.22 
 
 
442 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.71 
 
 
427 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  26.02 
 
 
475 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.02 
 
 
443 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.11 
 
 
438 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.06 
 
 
403 aa  100  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.7 
 
 
468 aa  100  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  24.49 
 
 
461 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  22.41 
 
 
427 aa  100  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  23.7 
 
 
463 aa  99.8  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.28 
 
 
395 aa  99.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  26.26 
 
 
473 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.69 
 
 
394 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.65 
 
 
396 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.65 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.93 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.57 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  22.91 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.46 
 
 
674 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.14 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.46 
 
 
420 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.07 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>