More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4071 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4071  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 432 aa  804    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000586904  normal  0.188824 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7361  membrane-fusion protein  98.84 
 
 		 432 aa  796    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661389  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.77 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.05 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.54 
 
 		 480 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.6 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.76 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.49 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.41 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.51 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  27.1 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.03 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1897  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.77 
 
 		 476 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.1 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.5 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.5 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.6 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.57 
 
 		 479 aa  136  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.79 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.84 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.01 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  28.33 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  26.3 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.74 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.54 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.4 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.22 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.81 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.71 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.12 
 
 		 448 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.16 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.71 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  28.16 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.38 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.77 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.73 
 
 		 674 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  25.82 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.11 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.48 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  24.55 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  26.73 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.88 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  27.83 
 
 		 473 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.34 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  26.7 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.73 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.56 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.25 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.25 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.25 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  25.69 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.88 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.68 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  23.25 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.25 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.87 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.7 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  25.77 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  25.77 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.35 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  26.72 
 
 		 446 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.21 
 
 		 469 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.27 
 
 		 474 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.01 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.85 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.27 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.2 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.94 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.58 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.57 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.32 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.73 
 
 		 514 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.12 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.75 
 
 		 394 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.51 
 
 		 447 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.47 
 
 		 458 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.49 
 
 		 466 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.49 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.82 
 
 		 508 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.04 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.25 
 
 		 460 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.46 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.09 
 
 		 518 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  26.03 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.88 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.14 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.44 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.03 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.49 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  28.21 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.35 
 
 		 460 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.94 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.06 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.43 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.12 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  21.53 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  21.72 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.12 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>