More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4000 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  74.44 
 
 		 460 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  84.03 
 
 		 457 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 457 aa  921    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  98.03 
 
 		 457 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  29.06 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 504 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.65 
 
 		 508 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  26.13 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  26.13 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.11 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  23.46 
 
 		 627 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.35 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.91 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.77 
 
 		 453 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  23.23 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.83 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 		 452 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.94 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  24.08 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  22.18 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.15 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.36 
 
 		 447 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.71 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  25.5 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  24.08 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.78 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.78 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  22.47 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.94 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  24.88 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.42 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  24.43 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.77 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.66 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  26.09 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.32 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.63 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  23.71 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.35 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.6 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  24.45 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  24.14 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.77 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  24.45 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.83 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.83 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  21.57 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  23.49 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  23.71 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.04 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  27.47 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.41 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  24.67 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.27 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.11 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.27 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.03 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.32 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  21.89 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.59 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  23.14 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.22 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  21.7 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.17 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.22 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.99 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.17 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.26 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.8 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  29.05 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.01 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 550 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  21.89 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  23.4 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  18.16 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  23.37 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.99 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.22 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  23.21 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.94 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.94 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.13 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  23.27 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  20.92 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  20.26 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.44 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  29.89 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.02 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.76 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  23.5 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.33 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  23.3 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.49 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  31.33 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.88 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.48 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  27.09 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>