More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2526 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  100 
 
 
417 aa  839    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  73.59 
 
 
396 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  61.87 
 
 
391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  43.97 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  39.24 
 
 
387 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  41.82 
 
 
377 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  30.42 
 
 
441 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  31.08 
 
 
347 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  29.14 
 
 
317 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  27.7 
 
 
417 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 
522 aa  139  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  37.39 
 
 
523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 
589 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 
576 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 
576 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  27.15 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  27.97 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.97 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  25.77 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.06 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.12 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.31 
 
 
481 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.6 
 
 
479 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.3 
 
 
390 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 
439 aa  90.1  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.52 
 
 
378 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.53 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.65 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  27.22 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.38 
 
 
389 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  24.23 
 
 
379 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.24 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.3 
 
 
465 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.3 
 
 
465 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  26.4 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.44 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.93 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  29.77 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.63 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.52 
 
 
491 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  21.69 
 
 
515 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.63 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  25.9 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.32 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.73 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.18 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.41 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.82 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  27.17 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.79 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.79 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.81 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  26 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  23.66 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  22.68 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  27.68 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  24.71 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.73 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  22.03 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  22.03 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.31 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  27.89 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.66 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  25 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.26 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.36 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.56 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  28.57 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.04 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.63 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.23 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  25.83 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  23.5 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.46 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.74 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.58 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.75 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.5 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.56 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.5 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  24.94 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.18 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.9 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  23.65 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.84 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.23 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.61 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  22.4 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  24.11 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  23.71 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  34.31 
 
 
726 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  23.72 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.83 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  23.98 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.63 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.83 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>