282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4509 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  100 
 
 		 418 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  44.23 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  31.75 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  31.9 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  31.67 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  29.62 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  32.08 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  30.97 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  28.67 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  27.4 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  27.4 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  27.4 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  27.4 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  27.4 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  27.4 
 
 		 603 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  27.4 
 
 		 603 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  27.17 
 
 		 538 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  27.13 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  27.08 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  30.66 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  27.17 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.08 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  26.82 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  23.53 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  23.53 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  23.53 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  25.61 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  25.61 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  25.61 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  25.61 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  25.61 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  25.61 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  25.61 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  26.1 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  23.36 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.36 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.36 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  23.36 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  26.7 
 
 		 400 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  23.58 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  25.99 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  22.51 
 
 		 441 aa  89.7  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.05 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.12 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.12 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0507  toxin secretion, membrane fusion protein  50 
 
 		 85 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  23.76 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.51 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  27.68 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  23.75 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  25.24 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  24.25 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  24.3 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  25.12 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  23.21 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  22.34 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.76 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.12 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.33 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.98 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  26.55 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  25.13 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.06 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.17 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.8 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.96 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.37 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  26.78 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.25 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.35 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.15 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  23.63 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.07 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 549 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.46 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 549 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  27.52 
 
 		 179 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  24.55 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  27.52 
 
 		 227 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  30.08 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  30.08 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>