More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0947 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  100 
 
 		 418 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  96.89 
 
 		 418 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  54.31 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  53.83 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  53.83 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  53.83 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  53.83 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  53.83 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  53.83 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  53.83 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  53.33 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  41.04 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  39.37 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  36.36 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  36.12 
 
 		 420 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  38.63 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.44 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  34.77 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  31.64 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  31.64 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  33.1 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  30.14 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  34.84 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  29.62 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  29.76 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  26.44 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  31.84 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  27.55 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  27.55 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  31.52 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  28.16 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.16 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  28.16 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.16 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  29.48 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  25.74 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  25.25 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  25.25 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  25.25 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  25.25 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  25.25 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  25.25 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.15 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.63 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.22 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.31 
 
 		 514 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  27.59 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  28.84 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  26.41 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  26.97 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.86 
 
 		 511 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.85 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.82 
 
 		 469 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.26 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.78 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.5 
 
 		 491 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.67 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.67 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  25.35 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.54 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.29 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  26.24 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.22 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  24.41 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.6 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.39 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.22 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.55 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.7 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.94 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.88 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  22.11 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.71 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.45 
 
 		 674 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  41.18 
 
 		 148 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.1 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  21.77 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  21.06 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.36 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.5 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  18.63 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  23.53 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  25.38 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  22.17 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.49 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.35 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.47 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.77 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>