61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02828 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  100 
 
 		 148 aa  296  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.14 
 
 		 419 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 414 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  33.33 
 
 		 414 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  38.13 
 
 		 428 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  33.82 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  41.18 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  33.33 
 
 		 420 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  33.33 
 
 		 420 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 431 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  31.62 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  31.62 
 
 		 445 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  32.88 
 
 		 538 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 432 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 443 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  31.51 
 
 		 603 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  31.51 
 
 		 603 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  31.51 
 
 		 422 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  31.51 
 
 		 422 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  33.59 
 
 		 461 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  31.51 
 
 		 422 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  31.51 
 
 		 422 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  31.51 
 
 		 422 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 458 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  26.57 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  26.57 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  25.78 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 419 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  33.07 
 
 		 431 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  33.96 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  33.67 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  31.25 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 		 413 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  24.32 
 
 		 418 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  24.39 
 
 		 413 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  27.7 
 
 		 457 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  31.36 
 
 		 431 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  31.36 
 
 		 431 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  31.36 
 
 		 431 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  31.36 
 
 		 431 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  31.36 
 
 		 431 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  31.36 
 
 		 431 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  31.36 
 
 		 431 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.57 
 
 		 472 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.07 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.94 
 
 		 468 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.51 
 
 		 442 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  31.51 
 
 		 442 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  29.66 
 
 		 431 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.66 
 
 		 431 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.66 
 
 		 431 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  27.45 
 
 		 441 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  29.66 
 
 		 431 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  34.4 
 
 		 412 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  38.16 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.17 
 
 		 466 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  35.63 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>