208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1723 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  100 
 
 
603 aa  843    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  100 
 
 
603 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  96.21 
 
 
538 aa  794    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  100 
 
 
422 aa  843    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  100 
 
 
422 aa  843    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  100 
 
 
422 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  100 
 
 
422 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  100 
 
 
422 aa  843    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  73.88 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  53.83 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  53.83 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  39.62 
 
 
428 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.41 
 
 
419 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  36.54 
 
 
420 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  38.59 
 
 
414 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  36.9 
 
 
420 aa  260  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 
414 aa  259  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  32.21 
 
 
431 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  33.41 
 
 
429 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  33.18 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  33.18 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  30.38 
 
 
415 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  30.73 
 
 
419 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  33.57 
 
 
461 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 
431 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  31.65 
 
 
445 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 
457 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  27.4 
 
 
418 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  27.62 
 
 
417 aa  186  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 
424 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
413 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.41 
 
 
387 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  30.71 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  26.05 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  26.05 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  27.46 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  27.23 
 
 
431 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  27.63 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  27.63 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  27.63 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  27.63 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  27.63 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  27.62 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.62 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.62 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  27.05 
 
 
431 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  26.23 
 
 
435 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  28.33 
 
 
400 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  23.56 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  26.5 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  24.08 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.75 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  24.46 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.6 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.6 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  45.92 
 
 
139 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.39 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.83 
 
 
514 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.05 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.48 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.48 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  23.44 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.54 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  23.14 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  23.1 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.78 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.02 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.78 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  22.88 
 
 
457 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  31.51 
 
 
148 aa  67  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  28.91 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 
576 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 
576 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.95 
 
 
447 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  31.39 
 
 
522 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  19.23 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.02 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.34 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.82 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  25.87 
 
 
376 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
447 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  23.17 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  27.81 
 
 
523 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  25.07 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.32 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  24.21 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  22.89 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.45 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  27.98 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  27.45 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.45 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.17 
 
 
467 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  22.6 
 
 
498 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  23.99 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>