More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2166 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 457 aa  891    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  100 
 
 		 445 aa  890    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  34.29 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.59 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  36.32 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  34.29 
 
 		 420 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 		 443 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  32.69 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  31.64 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  31.4 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  31.12 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  31.65 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  31.65 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  31.65 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  31.65 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  31.65 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  31.72 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  31.72 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  31.48 
 
 		 538 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  32.47 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  26.49 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  27.08 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  27.16 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  28.64 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  25.91 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  27.16 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  22.91 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  24.7 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  25.29 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  25.29 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  25.29 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  27.82 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  27.02 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  28.06 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  25.06 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  25.06 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  25.06 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.85 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  25.06 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  25.06 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  26.85 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  25.06 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.85 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  25.36 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 		 498 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.07 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.07 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.87 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.52 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.06 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  29.53 
 
 		 627 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  24.06 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.07 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  22.43 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.07 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.64 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.86 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.96 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  24.47 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.49 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.59 
 
 		 491 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.09 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.84 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  26.55 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 710 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.36 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  22.66 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  22.36 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  22.98 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.74 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  23.97 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.58 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  21.91 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  21.88 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  31.62 
 
 		 148 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  23.16 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  25.21 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  21.62 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.06 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  21.74 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.38 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  21.74 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.64 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  39.6 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>