More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01631 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  100 
 
 
414 aa  818    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  62.68 
 
 
420 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  62.44 
 
 
420 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  48.91 
 
 
414 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  41.97 
 
 
428 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  40.34 
 
 
419 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  40.24 
 
 
418 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  40 
 
 
418 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 
458 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  41.67 
 
 
538 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  34.45 
 
 
443 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  39.13 
 
 
422 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  39.13 
 
 
422 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  39.13 
 
 
422 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  39.13 
 
 
422 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  39.13 
 
 
422 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  39.13 
 
 
603 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  40.24 
 
 
603 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  36.32 
 
 
457 aa  239  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  36.32 
 
 
445 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 
432 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  33.17 
 
 
424 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  97.12 
 
 
139 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  30.32 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  30.79 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  30.84 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  31.08 
 
 
429 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  30.12 
 
 
413 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  32.63 
 
 
418 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  34.3 
 
 
431 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 
461 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  30.79 
 
 
429 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  30.79 
 
 
429 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 
387 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  28.5 
 
 
419 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  28.24 
 
 
417 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  33.1 
 
 
412 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  23.79 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  23.79 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  28.75 
 
 
431 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  28.75 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  28.75 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  28.75 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  28.75 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  28.75 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  29.61 
 
 
431 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  29.77 
 
 
431 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.77 
 
 
431 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.77 
 
 
431 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  29.24 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.82 
 
 
441 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 
466 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  27.11 
 
 
435 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.77 
 
 
480 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.76 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.93 
 
 
514 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  27.18 
 
 
447 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.93 
 
 
511 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.87 
 
 
480 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.41 
 
 
491 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.18 
 
 
447 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.06 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25 
 
 
480 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.3 
 
 
453 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.06 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  27.29 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.3 
 
 
447 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.01 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.01 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  25.52 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.9 
 
 
448 aa  87  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.88 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  27.32 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.58 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.32 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.81 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.53 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.1 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  27.16 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  20.89 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.78 
 
 
457 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.11 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  24.32 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  24.63 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.15 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.22 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
481 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  33.33 
 
 
148 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  29.33 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.75 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.79 
 
 
479 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.27 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  26.03 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.37 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.54 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.41 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.65 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.41 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>