More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2166 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
431 aa  856    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  38.98 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 
429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  37.2 
 
 
429 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  37.2 
 
 
429 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  34.77 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  33.81 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  36.01 
 
 
428 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 
414 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  32.21 
 
 
422 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  32.21 
 
 
422 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  32.21 
 
 
422 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  32.21 
 
 
422 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  32.21 
 
 
422 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 
461 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  32.21 
 
 
603 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  32.21 
 
 
603 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  32.45 
 
 
538 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  33.41 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  31.82 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  31.58 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  32.06 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  32.7 
 
 
458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  30.84 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 
457 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  28.88 
 
 
445 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  28.9 
 
 
415 aa  192  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  27.8 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  30.47 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  26.84 
 
 
419 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  26 
 
 
430 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  26 
 
 
430 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  26 
 
 
430 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  26.43 
 
 
417 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  26.67 
 
 
413 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  25.83 
 
 
424 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  25.4 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  27.74 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  28.81 
 
 
435 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.3 
 
 
387 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  27.49 
 
 
431 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  27.49 
 
 
431 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  27.49 
 
 
431 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  27.49 
 
 
431 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  27.49 
 
 
431 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  29.84 
 
 
412 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  27.49 
 
 
431 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.76 
 
 
431 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  26.76 
 
 
431 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.76 
 
 
431 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2165  hypothetical protein  76.81 
 
 
89 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  26.28 
 
 
431 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.16 
 
 
511 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.75 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.03 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.71 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  29.48 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.82 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.81 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  27.51 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.81 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.03 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.03 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.71 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  22.84 
 
 
441 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  33.82 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.41 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.4 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  23.29 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  22.69 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.08 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.41 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  23.45 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.19 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.19 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  23.01 
 
 
467 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  28.03 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  23.27 
 
 
567 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  24.85 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  27.81 
 
 
479 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.66 
 
 
491 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.84 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.18 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.9 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  24.05 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  29.21 
 
 
498 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.15 
 
 
480 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.88 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.27 
 
 
487 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.3 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  23.18 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.67 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.67 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.96 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.2 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25.73 
 
 
473 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.17 
 
 
475 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  24.11 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>