153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02987 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  100 
 
 		 425 aa  860    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  26.4 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  23.1 
 
 		 420 aa  96.3  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  23.1 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  26.82 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  24.88 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  26.28 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25.96 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  24.06 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  29.48 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  24.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  24.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  24.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  24.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  24.27 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  24.27 
 
 		 603 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  24.54 
 
 		 538 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  24.27 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  27.75 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  25 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  25.06 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  21.72 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  21.72 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  21.72 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  25.06 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  21.88 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  25.18 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  23.08 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  28.34 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.71 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  22.57 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  23.66 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  23.66 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  24 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  25.68 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  27.34 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  18.39 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.51 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  28.18 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  23.12 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  27.39 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.8 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  26.47 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.8 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  24.37 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.74 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.95 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  20.54 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25 
 
 		 473 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 509 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.41 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.21 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.41 
 
 		 453 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  23.18 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.61 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.86 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.38 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  24.92 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.66 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.1 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  26.14 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.1 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0056  putative type I secretion protein, HlyD family  22.75 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  24.04 
 
 		 498 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  27.01 
 
 		 491 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  26.84 
 
 		 506 aa  49.7  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 		 514 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  23.87 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  23.87 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.53 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  24.72 
 
 		 567 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  23.87 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  23.87 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  23.87 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  23.87 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.99 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.99 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.91 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  22.64 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  20.94 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.87 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.31 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.87 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.92 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.21 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4071  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000586904  normal  0.188824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>