More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0056 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0056  putative type I secretion protein, HlyD family  100 
 
 
442 aa  899    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.44 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.63 
 
 
452 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.63 
 
 
458 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.3 
 
 
453 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.47 
 
 
455 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  29.52 
 
 
378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.63 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.11 
 
 
487 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.47 
 
 
453 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.63 
 
 
458 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.98 
 
 
441 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  29.22 
 
 
378 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.38 
 
 
458 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  26.93 
 
 
488 aa  159  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  27.55 
 
 
463 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  27.29 
 
 
441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.93 
 
 
451 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.46 
 
 
443 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.75 
 
 
453 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.23 
 
 
430 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.17 
 
 
440 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  26.15 
 
 
481 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.59 
 
 
446 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.95 
 
 
443 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.21 
 
 
460 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.21 
 
 
460 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  27.52 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.08 
 
 
442 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.86 
 
 
460 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.48 
 
 
468 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.22 
 
 
460 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.57 
 
 
460 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.9 
 
 
460 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.39 
 
 
460 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.96 
 
 
460 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.96 
 
 
460 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.96 
 
 
460 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.96 
 
 
460 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  25.84 
 
 
463 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.65 
 
 
430 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.3 
 
 
460 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  26.29 
 
 
486 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  26.43 
 
 
460 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.18 
 
 
468 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.78 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.18 
 
 
468 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.65 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.74 
 
 
472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.53 
 
 
447 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  24.39 
 
 
461 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.3 
 
 
474 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.91 
 
 
389 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.06 
 
 
433 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.53 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.08 
 
 
474 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.73 
 
 
460 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.2 
 
 
460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.98 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.23 
 
 
468 aa  136  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.6 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.91 
 
 
472 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.24 
 
 
424 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.32 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.32 
 
 
446 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.53 
 
 
439 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.54 
 
 
395 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.7 
 
 
446 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.08 
 
 
428 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.65 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.9 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.9 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.06 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  25.9 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  25.24 
 
 
389 aa  131  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.66 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.85 
 
 
674 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.42 
 
 
396 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  25.6 
 
 
457 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.02 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.37 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  26.81 
 
 
391 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26 
 
 
399 aa  126  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.08 
 
 
474 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  24.22 
 
 
471 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  24.22 
 
 
469 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.77 
 
 
410 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.49 
 
 
389 aa  123  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.7 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  24.88 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.11 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.27 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.71 
 
 
467 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.04 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.04 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.97 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  25.18 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.49 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.16 
 
 
471 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.09 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>