110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1691 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  877    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  40.38 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  34.55 
 
 		 429 aa  272  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  52.84 
 
 		 352 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  29.69 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  27.76 
 
 		 430 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  30.49 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  22.46 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  36.7 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  22.22 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.14 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.8 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  31.05 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  34.38 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  28.77 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  30.34 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  22.37 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  25.73 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.47 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.83 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  23.31 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.95 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  25.13 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  24.63 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  25 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  29.31 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  24.07 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.49 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  24.26 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  24.26 
 
 		 603 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  29.08 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  22.88 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.09 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  24.39 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  29.2 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  24.26 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  24.26 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  24.26 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  24.26 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  24.26 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.31 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.52 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.22 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 498 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  28.8 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  27 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.02 
 
 		 511 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  20.87 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  22.26 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  22.46 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  22.74 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  22.74 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  25.88 
 
 		 227 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  24.09 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.56 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  26.32 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.21 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.84 
 
 		 523 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.09 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  27.52 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.96 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  26.32 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  22.16 
 
 		 576 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  22.16 
 
 		 576 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 522 aa  49.7  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.21 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  27.57 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  28.18 
 
 		 179 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.42 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  22.64 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.08 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.08 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  28.99 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  20.83 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.55 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  27.07 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  23.73 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  25.35 
 
 		 377 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.74 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.9 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 627 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.42 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  26.17 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  29.85 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  24.07 
 
 		 589 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  26.92 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.07 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  19.31 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>