54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0889 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  29.87 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  32.89 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  36.7 
 
 		 428 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  37.68 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  30 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  37.93 
 
 		 430 aa  62.4  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  40.3 
 
 		 429 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  28.23 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  30.53 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  28.48 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  31.75 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  25.41 
 
 		 420 aa  52  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  25.41 
 
 		 420 aa  52  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  26.23 
 
 		 538 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  31.65 
 
 		 441 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.93 
 
 		 491 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  24.59 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  24.59 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  24.59 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  24.59 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  24.59 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.44 
 
 		 469 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  32.53 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  24.59 
 
 		 603 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 576 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  25.18 
 
 		 418 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 576 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  24.59 
 
 		 603 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  27.46 
 
 		 417 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  26.13 
 
 		 415 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  26.77 
 
 		 418 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.77 
 
 		 418 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  26.85 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 		 522 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.35 
 
 		 455 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.29 
 
 		 508 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  23.12 
 
 		 457 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  21.5 
 
 		 504 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  32.29 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  21.49 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  26.09 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  26.81 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.24 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.37 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  36.21 
 
 		 473 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 509 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  30.4 
 
 		 379 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 509 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.35 
 
 		 523 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  33.8 
 
 		 456 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.58 
 
 		 475 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.48 
 
 		 514 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 424 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>