110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4794 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  76.22 
 
 
431 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  863    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  26.04 
 
 
431 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  27.76 
 
 
428 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  27.01 
 
 
429 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  25.94 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  37.63 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  27.11 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 
508 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  37.93 
 
 
244 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  24.53 
 
 
567 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  21.58 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  23.67 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  23.67 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  21.65 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  21.65 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.89 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  21.65 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  21.65 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  21.65 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  21.65 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  21.31 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  24.41 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.77 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  25 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  25 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  25 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  25.58 
 
 
418 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  25 
 
 
431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  22.43 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  22.43 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  29.32 
 
 
627 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  25.11 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  25.58 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.51 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  28.89 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.92 
 
 
438 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  23.33 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  23.33 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  23.33 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  22.38 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.91 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  19.96 
 
 
457 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  19.74 
 
 
457 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  29.81 
 
 
383 aa  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.22 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  21.48 
 
 
432 aa  50.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  25.95 
 
 
391 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.73 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  20.43 
 
 
473 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.79 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  22.88 
 
 
504 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.25 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.36 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.18 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.18 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  26.92 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.7 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.33 
 
 
477 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.67 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  28.25 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.42 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  20.52 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.18 
 
 
471 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  21.92 
 
 
429 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  26.67 
 
 
418 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.87 
 
 
432 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  22.35 
 
 
431 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  23.76 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.75 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.79 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.95 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.77 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.33 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  21.27 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  21.43 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.43 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.5 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  27.43 
 
 
498 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 
522 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  21.72 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  25.24 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.79 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.24 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  20.52 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4284  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.64 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.64 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.321467  normal  0.9163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  28.4 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.28 
 
 
465 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.28 
 
 
465 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.95 
 
 
674 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  16.99 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  20.47 
 
 
461 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.152026 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>