152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4232 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  29.82 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  28 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  26.2 
 
 		 429 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  25.94 
 
 		 430 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  30.49 
 
 		 428 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  34.97 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  25.35 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  33.67 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  25.12 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  25.12 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  21.9 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  22.86 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  24.06 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  29.38 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  30.34 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  26.23 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  25 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  23.66 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  24.63 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  27.11 
 
 		 509 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  30.99 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  28.04 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  20.77 
 
 		 504 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.46 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.23 
 
 		 514 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.56 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  24.3 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.68 
 
 		 441 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 429 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.24 
 
 		 472 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 429 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.01 
 
 		 447 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.47 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  23.17 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  21.79 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  23.25 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.77 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.73 
 
 		 491 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  22.36 
 
 		 431 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.46 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.3 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  37.08 
 
 		 417 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  27.95 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  27.48 
 
 		 479 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 506 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  21.37 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  27.4 
 
 		 498 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.94 
 
 		 466 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 515 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.93 
 
 		 511 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  25.44 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  22.18 
 
 		 567 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  20.23 
 
 		 414 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.82 
 
 		 451 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  23.25 
 
 		 433 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.25 
 
 		 433 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  28 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  26.24 
 
 		 443 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  24.6 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  23.53 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  28.09 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  29.12 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  25.81 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.12 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  28.18 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  24.07 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.1 
 
 		 473 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  22.43 
 
 		 627 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  25.81 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.29 
 
 		 475 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  23.66 
 
 		 710 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 467 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  26.72 
 
 		 461 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  27.49 
 
 		 576 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  19.94 
 
 		 506 aa  47  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.36 
 
 		 487 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  22.18 
 
 		 442 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  24.19 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  27.49 
 
 		 576 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  24.46 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1897  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.99 
 
 		 476 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.55 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  22.6 
 
 		 431 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  19.75 
 
 		 420 aa  46.2  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.46 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  27.27 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0056  putative type I secretion protein, HlyD family  19.92 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  19.51 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>