22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4700 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  44.33 
 
 		 431 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  40.86 
 
 		 431 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  37.63 
 
 		 430 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  26.32 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  31.68 
 
 		 352 aa  64.3  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  35.48 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  29.79 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 431 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  40.43 
 
 		 401 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  27.96 
 
 		 504 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28.83 
 
 		 418 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  28.45 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.45 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.45 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  28.83 
 
 		 418 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  28.45 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  32.93 
 
 		 441 aa  42.4  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  35 
 
 		 471 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  30 
 
 		 420 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  30 
 
 		 420 aa  40.8  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>