84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1297 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  76.22 
 
 		 430 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  29.69 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  27.21 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  29.86 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  28 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  37.91 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  40.86 
 
 		 182 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  37.68 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  24.65 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  22.34 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  20.43 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.37 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.37 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  23.37 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  23.37 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  25.3 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  20.49 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  20.49 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  20.49 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  20.49 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  20.49 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  20.49 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  24.73 
 
 		 515 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.73 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  22.11 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  21.11 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  24.65 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  23.55 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  22.84 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  30 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  21.68 
 
 		 504 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  23.26 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  25.55 
 
 		 360 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  22.85 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  23.08 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  28.36 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.49 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  21.24 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.68 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  25.1 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  22.3 
 
 		 445 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  22.3 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  21.37 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.08 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  21.85 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.27 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  39.76 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  23.72 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20 
 
 		 674 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.51 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  23.94 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  28.67 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.32 
 
 		 421 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  24.87 
 
 		 627 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  31.11 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  24.39 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  23.27 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.08 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  23.27 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.08 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  23.27 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  25.14 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.33 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  25 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.99 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  23.21 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  23.11 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.7 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  21.94 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  25.54 
 
 		 347 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  22.93 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  27.46 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  19.48 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  19.48 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>