More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0235 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  100 
 
 		 500 aa  1004    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  41.05 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 506 aa  355  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  37.7 
 
 		 710 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  29.72 
 
 		 567 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  47.92 
 
 		 360 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  24.42 
 
 		 508 aa  126  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  24.12 
 
 		 509 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  23.38 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  23.94 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.97 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.56 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.97 
 
 		 421 aa  93.6  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.38 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  21.78 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  24.38 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.65 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  20.89 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  20.94 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  23.23 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.06 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  21.95 
 
 		 486 aa  86.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.73 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.06 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.86 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.94 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.5 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.26 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.39 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  22.15 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.05 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.67 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.39 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.28 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.24 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  20.68 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.66 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  25.27 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.13 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.15 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  23.99 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  21.28 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.67 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.56 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.56 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.66 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.64 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  23.64 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.24 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.93 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.55 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  24.14 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  24.14 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.24 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.34 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.67 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.17 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  23.05 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  26.23 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.27 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  22.59 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.52 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.5 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.63 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  29.31 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  26.23 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  26.11 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.61 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.96 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.84 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.73 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.7 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  21.21 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.65 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.2 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.08 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.99 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.81 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.48 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  22.05 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  28 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.81 
 
 		 432 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  21.72 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  23.18 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.19 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.2 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  20.93 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  30.2 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.28 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.76 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>