More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0527 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 576 aa  1153    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 576 aa  1153    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  63.64 
 
 		 589 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  45.22 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  45.86 
 
 		 522 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  37.57 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  27.09 
 
 		 726 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 330 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 329 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  42.52 
 
 		 330 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5019  hypothetical protein  27.88 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  49.13 
 
 		 377 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  42.44 
 
 		 391 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  45.4 
 
 		 376 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  37.97 
 
 		 347 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 498 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  41.57 
 
 		 417 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  40.83 
 
 		 417 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  25.81 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  33.21 
 
 		 396 aa  123  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.09 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.67 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  37.06 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  24.42 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  24.42 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  36.9 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.9 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.5 
 
 		 473 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.15 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  34.48 
 
 		 457 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.21 
 
 		 474 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 		 460 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.13 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.24 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.59 
 
 		 471 aa  97.8  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.78 
 
 		 447 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.13 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  21.79 
 
 		 515 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.6 
 
 		 453 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.84 
 
 		 481 aa  95.1  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 		 458 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.78 
 
 		 447 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.29 
 
 		 467 aa  94  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.36 
 
 		 448 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.71 
 
 		 471 aa  93.6  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.9 
 
 		 456 aa  93.6  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  32.9 
 
 		 456 aa  93.6  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.83 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.14 
 
 		 453 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.64 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  28.46 
 
 		 447 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  22.16 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  28.67 
 
 		 473 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  22.66 
 
 		 627 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.58 
 
 		 453 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.87 
 
 		 472 aa  90.5  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.27 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.37 
 
 		 473 aa  88.6  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.85 
 
 		 469 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  30.37 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.18 
 
 		 445 aa  87.8  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.63 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.24 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  24.95 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.25 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.53 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  30.77 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  22.48 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  35.15 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.25 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  27.4 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  33.52 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.27 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.31 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.33 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.49 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.22 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.28 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.47 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.3 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.65 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  24.27 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.88 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.23 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.68 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  23.3 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.3 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.41 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.15 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.35 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.13 
 
 		 674 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  27.92 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.87 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  20.6 
 
 		 486 aa  77  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.92 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  22.65 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  34.04 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>