More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3423 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  65.58 
 
 
504 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
509 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  99.8 
 
 
509 aa  1028    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  49.26 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  42.27 
 
 
627 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  48.21 
 
 
515 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  34.36 
 
 
550 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 
549 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 
549 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  27.55 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  25.67 
 
 
498 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  25.85 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 
457 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  25.93 
 
 
460 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.99 
 
 
457 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  24.12 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  24.42 
 
 
576 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  24.42 
 
 
576 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.97 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.28 
 
 
451 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  24.26 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.56 
 
 
441 aa  113  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.16 
 
 
439 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.39 
 
 
488 aa  108  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.36 
 
 
523 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.17 
 
 
468 aa  107  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.29 
 
 
428 aa  107  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.9 
 
 
466 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  25.16 
 
 
434 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  23.33 
 
 
457 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.23 
 
 
443 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  23.67 
 
 
463 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.87 
 
 
474 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.05 
 
 
441 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.89 
 
 
473 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.44 
 
 
487 aa  101  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.88 
 
 
511 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.59 
 
 
440 aa  100  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.33 
 
 
473 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  22.1 
 
 
441 aa  100  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  25.22 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.88 
 
 
465 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.88 
 
 
465 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  22.49 
 
 
455 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  24.28 
 
 
506 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.89 
 
 
468 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  25.12 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.45 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  23.49 
 
 
449 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.93 
 
 
514 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  24.72 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.62 
 
 
477 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.65 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.54 
 
 
430 aa  95.1  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.81 
 
 
453 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.66 
 
 
458 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.66 
 
 
458 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  22.63 
 
 
463 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.28 
 
 
471 aa  94.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.29 
 
 
453 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.48 
 
 
458 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  24.52 
 
 
378 aa  93.6  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.21 
 
 
471 aa  93.6  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  23.64 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.96 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.89 
 
 
441 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.6 
 
 
466 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  23.85 
 
 
461 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  29.03 
 
 
439 aa  92.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.05 
 
 
442 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.13 
 
 
474 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.96 
 
 
455 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  21.63 
 
 
486 aa  90.1  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  23.08 
 
 
387 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.13 
 
 
474 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.08 
 
 
390 aa  90.1  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.33 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22 
 
 
674 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.97 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.15 
 
 
446 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  24.36 
 
 
589 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.44 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.24 
 
 
460 aa  87.4  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  28.72 
 
 
395 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.42 
 
 
395 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  28.16 
 
 
467 aa  87  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.58 
 
 
389 aa  86.7  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.39 
 
 
421 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  22.17 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  22.67 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.7 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.54 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.22 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  25 
 
 
442 aa  84  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  22.93 
 
 
710 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.7 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  25 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>