205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0782 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  878    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  42.34 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  40.38 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1297  hypothetical protein  27.21 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4794  hypothetical protein  26.04 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0835989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  39.29 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4232  hypothetical protein  29.82 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.183267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4700  hypothetical protein  44.33 
 
 		 182 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829428  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  23.39 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  31.17 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0889  hypothetical protein  32.89 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  28.95 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  28.95 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.73 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  28.19 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.99 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  26.42 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  27.59 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.59 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  25.55 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  23.76 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  22.04 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  24.86 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.94 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  30.28 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  26.17 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  26.17 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  26.17 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  26.17 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  26.17 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  23.61 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.47 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  21.38 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  20.95 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  26.17 
 
 		 603 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  26.17 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  25.52 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  24.74 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  24.51 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  24.16 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  22.22 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  22.95 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.46 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.12 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.12 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  24.16 
 
 		 509 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  24.16 
 
 		 509 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  24.76 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  22.99 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  24.77 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.44 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  32.43 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.84 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.29 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  26.67 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  29.73 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.73 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.28 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  31.53 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.73 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  31.53 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  31.53 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  21.72 
 
 		 567 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 		 508 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  31.53 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  31.53 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  31.53 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 710 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.19 
 
 		 403 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21 
 
 		 455 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  29.73 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.87 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.66 
 
 		 514 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  21.18 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.67 
 
 		 473 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.01 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  22.67 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  27.32 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  19.73 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  31.21 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  22.99 
 
 		 515 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  24.63 
 
 		 457 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  24.63 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.09 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.7 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  29.45 
 
 		 179 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.09 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.87 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  22.69 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.69 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  25.34 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  21.88 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>