282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8164 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 443 aa  884    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  38.94 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  38.46 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  38.46 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  38.46 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  38.46 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  38.46 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  38.94 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  38.94 
 
 		 603 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  38.94 
 
 		 603 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  39.95 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  38.94 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  34.45 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  32.54 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  32.54 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.41 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 414 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  32.45 
 
 		 445 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  33.41 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 432 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  30.41 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  26.93 
 
 		 413 aa  192  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  27.55 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  26.7 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  28.13 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  31.34 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  31.26 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  31.55 
 
 		 431 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  22.63 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  22.63 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  22.63 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  26.97 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  25.85 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  26.08 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  25.81 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  25.81 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  25.81 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  25.81 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  25.81 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  25.81 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.78 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.94 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.81 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  24.81 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.81 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  24.56 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  26.63 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.82 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.58 
 
 		 511 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.61 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  27.58 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  27.12 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.72 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.96 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.75 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  27.46 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.12 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.37 
 
 		 457 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.42 
 
 		 466 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.34 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  24.43 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.81 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  23.89 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.09 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  32.24 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.75 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  25.46 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.87 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.76 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.76 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.23 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  24.72 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.82 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  28.81 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.81 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.21 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  20.9 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  22.51 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.33 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25.21 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  31.45 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  24.49 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.88 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.13 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  24.38 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  25.7 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>