196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04478 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  100 
 
 		 412 aa  792    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  30.24 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  30.24 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  30.24 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  30.24 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  30.24 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  30 
 
 		 538 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  30.24 
 
 		 603 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  32.94 
 
 		 414 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  30.24 
 
 		 603 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  28.91 
 
 		 424 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  31.28 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  31.52 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  29.3 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  29.07 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  31.07 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  28.06 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  30.3 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  27.45 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  30.61 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  27.27 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  24.82 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  30.16 
 
 		 431 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  24.88 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  24.41 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  24.41 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  27.01 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  21.23 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  22.1 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  20.52 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  20.05 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  23.68 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  23.68 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  23.68 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  23.68 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  23.68 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  23.68 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.15 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.79 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.16 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.04 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  27.49 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.6 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  23.86 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.58 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  23.86 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.86 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.86 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  24.46 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  25.77 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.67 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.75 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  24.82 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  34.15 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.75 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  24.88 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  26.35 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.8 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  39 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  26.3 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.66 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.65 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  18.36 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.24 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.45 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  22.07 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.2 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.04 
 
 		 480 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.09 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  23.21 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.38 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  25.68 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.27 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  24.27 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  23.73 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  25.51 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.73 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.73 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>