299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03509 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  100 
 
 		 417 aa  853    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  31.75 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  30.95 
 
 		 415 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  30.41 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  30 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  29.76 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  29.88 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  26.49 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  26.49 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  26.49 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  26.49 
 
 		 538 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  26.49 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  26.49 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  26.9 
 
 		 603 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  26.9 
 
 		 603 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  31.87 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  27.25 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  28.5 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  28.27 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  27.27 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  27.45 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  27.16 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  27.16 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  27.71 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  28.95 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  23.5 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 		 461 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  26.11 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  26.11 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  26.11 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  26.11 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  26.11 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  26.11 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  25.86 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.56 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  25.56 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.56 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  25.99 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  24.06 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  24.06 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  24.06 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.09 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  23.37 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  25.41 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  24.4 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.64 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  23.86 
 
 		 457 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  24.08 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  24.15 
 
 		 508 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.76 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  24.57 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  23.25 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.59 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.01 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  22.49 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.03 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.03 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  24.25 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  23.8 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  22.94 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  22.51 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  25.56 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.14 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.58 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.38 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  26.41 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.57 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  22.92 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.7 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  22.98 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.03 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  22.77 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.83 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.28 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.01 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.56 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.01 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  23.13 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.33 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.58 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.48 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 576 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.98 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 576 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  22.22 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  23.58 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  22.87 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>