228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0106 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  100 
 
 		 430 aa  883    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 430 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  100 
 
 		 430 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.55 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  24.7 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  24.7 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  27.08 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  25.53 
 
 		 458 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  24.37 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  26.5 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  23.92 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  26 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  25.4 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  26.05 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  26.05 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  26.05 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  26.05 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  26.05 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  26.05 
 
 		 603 aa  136  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  26.05 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  23.85 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  25.29 
 
 		 445 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  25.29 
 
 		 457 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  24.2 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  22.79 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  22.63 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  24.38 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  23.53 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  23.28 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  23.28 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  23.28 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  23.28 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  23.28 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  23.28 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  23.91 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  25.68 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  22.3 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.3 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  22.3 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  21.08 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  24.06 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  21.63 
 
 		 413 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  22.42 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  20.98 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  20.84 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  23.54 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  21.12 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.46 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  22.33 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  21.54 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.7 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  19.6 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  20.12 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.91 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  23.6 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  22.28 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.95 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  23.08 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  24.67 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  23.29 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.34 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.64 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.5 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.96 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  22.34 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  26.57 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.48 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  20.09 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  22.34 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  20.77 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.62 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  25.34 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.16 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  22.83 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.04 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  19.51 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.83 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  22.15 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  22.94 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  22.91 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.83 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  19.77 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.44 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.56 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.99 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  20.04 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  21.46 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.28 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.15 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  23.76 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  22.81 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  31.53 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.82 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  25.47 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>