159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3756 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 435 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  30.47 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  30.12 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  27.27 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  28.61 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  26.21 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  28.84 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28.35 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  26.1 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  27.37 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  26.87 
 
 		 603 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  26.87 
 
 		 603 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  26.87 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  26.87 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  26.87 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  26.87 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  26.87 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  27.11 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  27.13 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  24.65 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  22.73 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  25 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  24.31 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  24.47 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  25.81 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  22 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 429 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 		 508 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  22.77 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  24.63 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  33.7 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  25.5 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  34.05 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  24.42 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  24.42 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  24.42 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  24.42 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  24.42 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  24.42 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  29.89 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  21.1 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  21.1 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  21.1 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.71 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.09 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  23.42 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.06 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.22 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  25.91 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.91 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.91 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  26.03 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  26.26 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  21.37 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  28.78 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  20.82 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.13 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.08 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  25.64 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  25.34 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  33.13 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.16 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.94 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.94 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.88 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  21.97 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  21.97 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  24.44 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  28.76 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.4 
 
 		 481 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.51 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.85 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  24.27 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.47 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  20 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  21.64 
 
 		 387 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  20.19 
 
 		 317 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.9 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  22.88 
 
 		 498 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.78 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  23.29 
 
 		 338 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  26.23 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  25.35 
 
 		 567 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 550 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.18 
 
 		 456 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>