More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1183 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  100 
 
 
317 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  30.66 
 
 
391 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  31.96 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  30.77 
 
 
376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.8 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  29.14 
 
 
417 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 
330 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 
330 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  28 
 
 
396 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  31.33 
 
 
329 aa  149  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  30.72 
 
 
387 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  27.25 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  40.27 
 
 
522 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  39.07 
 
 
523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 
576 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 
576 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  25.65 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 
589 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  25.54 
 
 
383 aa  99.4  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.86 
 
 
378 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  24.79 
 
 
378 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 
508 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.13 
 
 
514 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.13 
 
 
511 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.11 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  22.54 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.63 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.81 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  27.78 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  27.03 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.7 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  26.28 
 
 
504 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  29.53 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  32.34 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.91 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 
498 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1076  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  22.37 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.656863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.97 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  26.95 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.86 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  22.28 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.56 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.79 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  28.57 
 
 
439 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.92 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.19 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  20.92 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.56 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.63 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.63 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  24.32 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 
439 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.07 
 
 
447 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  28.4 
 
 
467 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  24.32 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  30.07 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.58 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.16 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.27 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  23.49 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.79 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  26.75 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.17 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.38 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.29 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.49 
 
 
465 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  27.45 
 
 
457 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.49 
 
 
465 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.49 
 
 
416 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  27.32 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.9 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.32 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.48 
 
 
453 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.06 
 
 
442 aa  65.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  25.81 
 
 
473 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.87 
 
 
441 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  25.49 
 
 
460 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.01 
 
 
458 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.2 
 
 
442 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.01 
 
 
458 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.01 
 
 
458 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.59 
 
 
458 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.24 
 
 
396 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  27.27 
 
 
479 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  24.62 
 
 
461 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.97 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  26.1 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  23.24 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.24 
 
 
396 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.24 
 
 
396 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.91 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.24 
 
 
396 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.83 
 
 
473 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>