More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1076 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1076  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  564  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.656863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  59.55 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  58.99 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  61.18 
 
 		 455 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.72 
 
 		 452 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  58.55 
 
 		 458 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  59.06 
 
 		 451 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.89 
 
 		 458 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.89 
 
 		 458 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  52.3 
 
 		 453 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.89 
 
 		 458 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  49.11 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  49.7 
 
 		 378 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  49.7 
 
 		 378 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  53.02 
 
 		 446 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  47.68 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  45.61 
 
 		 471 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  50.34 
 
 		 442 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  49.13 
 
 		 463 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  49.69 
 
 		 488 aa  161  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46.47 
 
 		 447 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  51.68 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  49.66 
 
 		 466 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  48.37 
 
 		 444 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  50.34 
 
 		 471 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  47.88 
 
 		 487 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  44.44 
 
 		 471 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  48.3 
 
 		 674 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  50.67 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.04 
 
 		 430 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  45.09 
 
 		 439 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  50 
 
 		 486 aa  152  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  47.65 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.65 
 
 		 468 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  48 
 
 		 463 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46.36 
 
 		 480 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  44.13 
 
 		 433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  38.24 
 
 		 461 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.1 
 
 		 474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.69 
 
 		 474 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  43.71 
 
 		 460 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.45 
 
 		 474 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.32 
 
 		 473 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.54 
 
 		 460 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.31 
 
 		 460 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.35 
 
 		 460 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.18 
 
 		 472 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.44 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.44 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  39.05 
 
 		 455 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.18 
 
 		 460 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  41.44 
 
 		 484 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.76 
 
 		 460 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.32 
 
 		 460 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.44 
 
 		 460 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.62 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 460 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.78 
 
 		 468 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.56 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.56 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.56 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.56 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.27 
 
 		 472 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  41.38 
 
 		 395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46.05 
 
 		 396 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  41.38 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.46 
 
 		 395 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  43.24 
 
 		 439 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.39 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  46 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.38 
 
 		 416 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.5 
 
 		 439 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  46 
 
 		 391 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  40.65 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44 
 
 		 394 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  37.43 
 
 		 469 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  37.43 
 
 		 471 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.33 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.33 
 
 		 394 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.19 
 
 		 424 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.33 
 
 		 394 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.33 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.33 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.22 
 
 		 437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.76 
 
 		 389 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.89 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.76 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.88 
 
 		 390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.22 
 
 		 390 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  35.86 
 
 		 390 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.82 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  35.85 
 
 		 441 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.27 
 
 		 441 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.16 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.63 
 
 		 427 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.59 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.76 
 
 		 468 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>