More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01311 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  31.63 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  33.61 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  33.75 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  29.57 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  31.08 
 
 		 417 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  30.55 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  29.11 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  42.6 
 
 		 523 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  31.71 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  31.18 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  30.64 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  31.07 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 522 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 576 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 576 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  38.71 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  27.25 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  27.14 
 
 		 457 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.29 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  31.29 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  25.25 
 
 		 434 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.36 
 
 		 468 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  34.45 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  25 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 457 aa  89.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.5 
 
 		 447 aa  89.7  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  31.84 
 
 		 479 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  25.56 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  26.25 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.87 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  33.33 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  26.4 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  23.86 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  32.43 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.74 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  31.5 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.45 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.43 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  27.36 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.5 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.4 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  26.13 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.69 
 
 		 447 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.53 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.34 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.03 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  24.39 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.72 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.04 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.05 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  25.28 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.95 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  25.28 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 		 504 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.55 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.81 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.02 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  25.83 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.81 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  31.79 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  31.79 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  22.64 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.79 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.25 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.64 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.87 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.99 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  37.14 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.64 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.04 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  26.38 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 515 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  26.38 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.56 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.56 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.5 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.36 
 
 		 480 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  29.52 
 
 		 227 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  22.93 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.13 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  24.36 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.12 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  23.08 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  22.94 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.91 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  30.99 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5251  hypothetical protein  24.27 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.94 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.48 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  24 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.7 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  26.78 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  23.73 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  29.71 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>