More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4909 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
404 aa  833    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 
359 aa  229  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 
379 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  29.07 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  25.56 
 
 
347 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  26.99 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.12 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.14 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  31.37 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  25.13 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.58 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  23.51 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.29 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  28.8 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  22.42 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  33.33 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  21.54 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.53 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.41 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  23.26 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  22.14 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.81 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  21.98 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 
589 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 
522 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  23.82 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.43 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.16 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.4 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.35 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.07 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  23.5 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.93 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.03 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.23 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  25.37 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.26 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.64 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.56 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.92 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.64 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  23.06 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  28.22 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.43 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  24.24 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.04 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  28.78 
 
 
627 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  26.09 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.14 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.81 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.33 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  25.13 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  21.53 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.15 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.01 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  24.94 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.98 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.62 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.68 
 
 
674 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  18.95 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.98 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 
576 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.35 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 
576 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.88 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  22.4 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  22.51 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  23.22 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.35 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  21.35 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.58 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.19 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  21.98 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  25.53 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  29.06 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  21.85 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.41 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  21.54 
 
 
567 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.04 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.04 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.05 
 
 
471 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.65 
 
 
445 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  24.46 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.74 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.11 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.7 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.2 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  22.56 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.26 
 
 
480 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.21 
 
 
471 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  22.71 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.22 
 
 
447 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.28 
 
 
487 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  23.2 
 
 
475 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.1 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.1 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.28 
 
 
511 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  22.71 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>