44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01629 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  100 
 
 		 139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  97.12 
 
 		 414 aa  204  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  65.69 
 
 		 420 aa  140  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  64.71 
 
 		 420 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  53.92 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  38.24 
 
 		 428 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  43 
 
 		 418 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  43 
 
 		 418 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  36.73 
 
 		 415 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 457 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  39.6 
 
 		 445 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.45 
 
 		 419 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  46.94 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  41.35 
 
 		 432 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  34 
 
 		 413 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  45.92 
 
 		 422 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  45.92 
 
 		 422 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  45.92 
 
 		 422 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  45.92 
 
 		 422 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  45.92 
 
 		 422 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  45.92 
 
 		 603 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  45.92 
 
 		 603 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  30.69 
 
 		 443 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  39 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  34 
 
 		 418 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  32.73 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0507  toxin secretion, membrane fusion protein  41.03 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  32.17 
 
 		 419 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  25.24 
 
 		 430 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 430 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  25.24 
 
 		 430 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  42.37 
 
 		 441 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 		 387 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2165  hypothetical protein  41.94 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  28.24 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02826  membrane-fusion protein  39.58 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.57 
 
 		 448 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>