26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02826 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02826  membrane-fusion protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  44.78 
 
 
457 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  44.78 
 
 
445 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 
443 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.8 
 
 
419 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  40.79 
 
 
428 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  36.71 
 
 
418 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  34.62 
 
 
414 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  29.89 
 
 
422 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  29.89 
 
 
422 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  29.89 
 
 
422 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  29.89 
 
 
422 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  29.89 
 
 
422 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  29.89 
 
 
538 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  37.33 
 
 
431 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  29.89 
 
 
603 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  29.89 
 
 
603 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  43.75 
 
 
420 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  32.1 
 
 
458 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  43.75 
 
 
420 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  43.66 
 
 
429 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  32.47 
 
 
418 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 
431 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 
429 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 
429 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  39.58 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>