65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0871 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  752    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  27.29 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  25.85 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  27.37 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  29.61 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  35.79 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  25.85 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  29.96 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 509 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  27.18 
 
 		 666 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  27.75 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  22.4 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  27.85 
 
 		 169 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  20.84 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.84 
 
 		 491 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  23.35 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  22.57 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.92 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  20.61 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2348  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.02 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  20.51 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.59 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.97 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 		 410 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15721  hypothetical protein  21.85 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.88 
 
 		 447 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.17 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.98 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  22.87 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  23.14 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  23.14 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  26.53 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  21.73 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.51 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0559  hypothetical protein  23.43 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  23.23 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  25.4 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.98 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  23.83 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  28.36 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1668  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.64 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0614  hypothetical protein  26.34 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4428  RND family efflux transporter MFP subunit  24.41 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  21.74 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0112  RND family efflux transporter MFP subunit  23.61 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  22.86 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  21.18 
 
 		 463 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 407 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  21.4 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.6 
 
 		 480 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.61 
 
 		 583 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>