More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0994 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69 
 
 		 579 aa  730    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  66.79 
 
 		 581 aa  697    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 583 aa  1142    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.41 
 
 		 573 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  74.2 
 
 		 583 aa  814    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  67.75 
 
 		 579 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.27 
 
 		 579 aa  747    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.79 
 
 		 575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  56.35 
 
 		 564 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  56.97 
 
 		 575 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.35 
 
 		 569 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.89 
 
 		 575 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  45.87 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.39 
 
 		 573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.14 
 
 		 575 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  34.3 
 
 		 563 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  37.66 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  37.66 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.91 
 
 		 371 aa  203  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  37.98 
 
 		 372 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  38.28 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  39.27 
 
 		 377 aa  193  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  37.23 
 
 		 366 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  38.52 
 
 		 372 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  36.87 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  35.52 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  35.45 
 
 		 369 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  39.37 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 524 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  38.57 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  38.57 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  24.03 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  34.97 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  36.72 
 
 		 186 aa  67  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 627 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.29 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  35.34 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.93 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  26.1 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 		 671 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 		 683 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  22.85 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.47 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.36 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 		 460 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.33 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  23.81 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  27.63 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  38.6 
 
 		 180 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  24.2 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.51 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  23.81 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.67 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  24.38 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 364 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  23.6 
 
 		 456 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  22.39 
 
 		 640 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  28.13 
 
 		 383 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  24.25 
 
 		 376 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  22.36 
 
 		 502 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 368 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  29.1 
 
 		 475 aa  54.7  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 546 aa  54.3  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  23.26 
 
 		 509 aa  53.9  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  31.15 
 
 		 518 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 		 538 aa  53.9  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  25 
 
 		 537 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 		 403 aa  53.5  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.3 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  28.72 
 
 		 194 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  30.98 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2808  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 378 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.635113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.26 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2152  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 		 391 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 705 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  27.21 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>