More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3470 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 564 aa  1088    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.73 
 
 		 575 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  59.93 
 
 		 583 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.34 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.69 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.89 
 
 		 579 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.27 
 
 		 583 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  59.68 
 
 		 581 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.73 
 
 		 573 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  56.45 
 
 		 575 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.73 
 
 		 575 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.9 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  49.09 
 
 		 544 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.94 
 
 		 573 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.3 
 
 		 575 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  37.11 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  41.85 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  41.85 
 
 		 370 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  44.23 
 
 		 372 aa  220  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  42.59 
 
 		 370 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  41.76 
 
 		 377 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.92 
 
 		 371 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  43.94 
 
 		 372 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  39.62 
 
 		 366 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  36.49 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  36.91 
 
 		 340 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  36.13 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  26.41 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  28.01 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 404 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  41.04 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 468 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  26.6 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.35 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  39.53 
 
 		 180 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  25.54 
 
 		 504 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.8 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  32.8 
 
 		 186 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  26.75 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  38.73 
 
 		 186 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  30.22 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  24.85 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  23.27 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  34.35 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 607 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  31.41 
 
 		 396 aa  57  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 715 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  27.24 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 526 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  25.95 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  22.58 
 
 		 456 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 466 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  25.95 
 
 		 445 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  25.95 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 		 376 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 		 530 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1144  hypothetical protein  34.43 
 
 		 183 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2868  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 		 364 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 420 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1081  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 468 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  24.1 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 		 587 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 465 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  25.95 
 
 		 576 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  31.98 
 
 		 470 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>