149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2673 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  715    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  83.87 
 
 		 370 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  78.55 
 
 		 372 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  70.86 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  70.86 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  69.92 
 
 		 377 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.19 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  63.32 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  64.36 
 
 		 366 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  48.27 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  50.28 
 
 		 563 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  47.67 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.65 
 
 		 575 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 		 573 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.22 
 
 		 575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  43.12 
 
 		 564 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.79 
 
 		 579 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.99 
 
 		 583 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.37 
 
 		 579 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.37 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  41.64 
 
 		 544 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 583 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.44 
 
 		 569 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  41.07 
 
 		 581 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.74 
 
 		 573 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.01 
 
 		 575 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 575 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.06 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  26.35 
 
 		 527 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 524 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.91 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.75 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 568 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  30.47 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  21.82 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  30.47 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  28.3 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 537 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.47 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 627 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.32 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.91 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  33.18 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  25.68 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2808  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.635113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  26.69 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  23 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 582 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 504 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  23.97 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  24.94 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 553 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  24.39 
 
 		 500 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  25.71 
 
 		 253 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 504 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  28.18 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0065  RND family efflux transporter MFP subunit  20.9 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  25.42 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.18 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  24.51 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 367 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  22.11 
 
 		 467 aa  46.2  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  25.39 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  32.03 
 
 		 484 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2802  multidrug/cation efflux pump, membrane fusion protein subunit  29.41 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  24.14 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1497  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.432966 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  24.65 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>