More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4090 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 575 aa  1134    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  65.46 
 
 		 564 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.89 
 
 		 579 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.79 
 
 		 579 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.11 
 
 		 579 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  58.33 
 
 		 583 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  60.68 
 
 		 581 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.5 
 
 		 583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.27 
 
 		 573 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  55.64 
 
 		 575 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.12 
 
 		 575 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.58 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  47.74 
 
 		 544 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.62 
 
 		 573 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  36.47 
 
 		 563 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  43.16 
 
 		 370 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  43.16 
 
 		 370 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  42.3 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  43.6 
 
 		 370 aa  230  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  40.41 
 
 		 377 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.11 
 
 		 371 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  44.23 
 
 		 372 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  40.38 
 
 		 366 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  39.39 
 
 		 340 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  35.83 
 
 		 368 aa  190  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  35.43 
 
 		 369 aa  180  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 514 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  23.53 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.97 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 		 627 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  26.63 
 
 		 405 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  25.67 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 715 aa  70.5  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.48 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 354 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.03 
 
 		 406 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  28.44 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3189  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 683 aa  67  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  24.73 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  23.64 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.32 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  23 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.67 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  24.83 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 382 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.73 
 
 		 358 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.73 
 
 		 358 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  25.36 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  33.59 
 
 		 186 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 404 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 354 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  22.06 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1427  secretion protein HlyD  24.25 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  23.36 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  23.23 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  35.46 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.18 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  32.17 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  25.58 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  20.56 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.15 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  25.88 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  26.9 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  30.88 
 
 		 186 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  22.05 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  25.23 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.28 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  24.43 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  21.47 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  21.49 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3357  RND family efflux transporter MFP subunit  29.36 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.748521  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  25.26 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  21.84 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  21.29 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  21.29 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  25 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  21.29 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>