More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5617 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.92 
 
 		 579 aa  780    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.75 
 
 		 579 aa  798    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.58 
 
 		 579 aa  801    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 573 aa  1102    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  73.32 
 
 		 581 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.36 
 
 		 583 aa  699    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  68.13 
 
 		 583 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.82 
 
 		 575 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.14 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  58.26 
 
 		 564 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  59.03 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.26 
 
 		 575 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  51.89 
 
 		 544 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.07 
 
 		 573 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.07 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  35.44 
 
 		 563 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  38.73 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  38.73 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  40.48 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  41.09 
 
 		 377 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 		 371 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  40.79 
 
 		 370 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  39.62 
 
 		 366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  39.21 
 
 		 369 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  37.27 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  40.48 
 
 		 372 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  37.36 
 
 		 340 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  42.06 
 
 		 184 aa  79  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  39.31 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  41.79 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.37 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.27 
 
 		 404 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  23.24 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  41.41 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  41.41 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.75 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  30.17 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  40.15 
 
 		 207 aa  67  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  25.99 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  24.68 
 
 		 422 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  24.29 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  28.89 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  44.19 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.06 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24.76 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.9 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.16 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  38.21 
 
 		 186 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  25.37 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.37 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  24.51 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.98 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  31.54 
 
 		 391 aa  57  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  25.9 
 
 		 356 aa  57  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 715 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  27.04 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  23.62 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  23.64 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.26 
 
 		 373 aa  56.2  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.57 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  38.1 
 
 		 186 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  23.35 
 
 		 382 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 		 381 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  25 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  23.64 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.72 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  34.85 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 564 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>