More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2950 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  85.35 
 
 		 575 aa  838    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  82.12 
 
 		 575 aa  852    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 569 aa  1091    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.96 
 
 		 579 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.19 
 
 		 579 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.17 
 
 		 583 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.32 
 
 		 579 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  59.68 
 
 		 581 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  57.52 
 
 		 583 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.52 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.58 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  57.35 
 
 		 564 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  50.46 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.68 
 
 		 573 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.47 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  36.89 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  38.79 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  38.96 
 
 		 372 aa  198  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  38.79 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  39.31 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  38.79 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  36.7 
 
 		 368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  39.39 
 
 		 377 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.83 
 
 		 371 aa  182  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  37.97 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  40.17 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  35.91 
 
 		 340 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  44.2 
 
 		 184 aa  90.1  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  48.25 
 
 		 185 aa  87.4  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  39.52 
 
 		 186 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.01 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  30.18 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  30.49 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  37.96 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.45 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  27.47 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 404 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  43.7 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  43.7 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  27.04 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.23 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1144  hypothetical protein  42.4 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31030  putative cation efflux system protein  31.55 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000427913  unclonable  4.33311e-22 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  30.27 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 		 564 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 379 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 		 473 aa  57  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.6 
 
 		 399 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  24.21 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  23.64 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  24.27 
 
 		 365 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  23.64 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  38.33 
 
 		 186 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  32.42 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  23.64 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  24.72 
 
 		 406 aa  55.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  29.95 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  26.72 
 
 		 504 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 395 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  23.02 
 
 		 352 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  31.28 
 
 		 550 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  23.7 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 364 aa  55.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  24.2 
 
 		 354 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  25.67 
 
 		 395 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 371 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 456 aa  53.9  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 		 715 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  31.39 
 
 		 396 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.13 
 
 		 350 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 		 346 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  33.62 
 
 		 207 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.16 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  25 
 
 		 363 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1676  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  24.93 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>