226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3405 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3405  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1056    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.92 
 
 		 579 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  48.77 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.23 
 
 		 575 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.38 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.22 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  49.37 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5617  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.82 
 
 		 573 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.06 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  47.75 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3059  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.48 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3470  RND family efflux transporter MFP subunit  57.91 
 
 		 564 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025961  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.36 
 
 		 579 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.5 
 
 		 573 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4730  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 		 575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  35.59 
 
 		 563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2383  hypothetical protein  40.18 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2096  hypothetical protein  40.18 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  40.12 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4568  hypothetical protein  40.24 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0143  hypothetical protein  36.63 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1143  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1650  hypothetical protein  39.53 
 
 		 370 aa  180  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419449  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1741  hypothetical protein  36.42 
 
 		 369 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2673  hypothetical protein  40.41 
 
 		 372 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0902591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18560  hypothetical protein  37.09 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2618  hypothetical protein  34.81 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419605  normal  0.60812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1331  hypothetical protein  38.38 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.218799  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1651  hypothetical protein  40.65 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146789  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2619  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.698231  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4567  hypothetical protein  36.81 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2672  hypothetical protein  40.97 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0580335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2384  hypothetical protein  34.64 
 
 		 187 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2097  hypothetical protein  34.64 
 
 		 187 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18550  hypothetical protein  48.39 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.18 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0142  hypothetical protein  39.01 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  23.15 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.31 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.31 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  23.12 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 372 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  25.65 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 402 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  24 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 627 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.32 
 
 		 386 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.34 
 
 		 564 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 459 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1740  hypothetical protein  30.57 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 404 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  23.87 
 
 		 537 aa  54.7  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 		 362 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 671 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 411 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  26.47 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  30.65 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 526 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.65 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.28 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 399 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  23.54 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  20.56 
 
 		 388 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  23.82 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  22.52 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2868  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  27.05 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  22.93 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  27.05 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 568 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.72 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  23.1 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  28.02 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  28.99 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 359 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 683 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 		 607 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21 
 
 		 400 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 356 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  22.99 
 
 		 520 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  22.99 
 
 		 520 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 473 aa  50.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  25.71 
 
 		 394 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  29.35 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.59 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>