More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2170 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 390 aa  767    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  37.97 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  34.58 
 
 		 375 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 380 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  31.83 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  32.54 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  29.4 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  23.24 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  31.21 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0019  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 410 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 376 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  31.15 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  30.95 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  27.24 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  31.27 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 		 519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.817622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  26.38 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  28.04 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  27.16 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  28.9 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.63 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  26.37 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 427 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.38 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  30.49 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  30.03 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 		 530 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 671 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  23.6 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  24.59 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.47 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 397 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  23.96 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  29.69 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  26.82 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 537 aa  96.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 359 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  27.67 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  27.96 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 		 587 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  27.83 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  25.25 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 537 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 538 aa  94  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.55 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.55 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 466 aa  93.6  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  26.35 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 538 aa  92.8  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  26.11 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  29.31 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.84 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  26.51 
 
 		 520 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 537 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  26.51 
 
 		 520 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  26.23 
 
 		 489 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  25.9 
 
 		 489 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  26.23 
 
 		 516 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  25.9 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  25.9 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  25.9 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  25.9 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 579 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>