More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2448 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  100 
 
 		 382 aa  741    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  67.39 
 
 		 387 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  62.27 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  38.07 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  36.31 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  37.32 
 
 		 404 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  37.13 
 
 		 538 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.4 
 
 		 454 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  36.73 
 
 		 459 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  34.35 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  34.87 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  33.17 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.95 
 
 		 457 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  33.87 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  36.66 
 
 		 503 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  32.95 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 		 454 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  36.2 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  34.65 
 
 		 484 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  37.36 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  33.73 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 		 416 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  34.69 
 
 		 520 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  35.14 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  34.69 
 
 		 520 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.05 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  34.37 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  32.75 
 
 		 502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  37.72 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 407 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  34.7 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  33.42 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  35.07 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  34.4 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  34.4 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  29.84 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  35.36 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  34.11 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  36.24 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  35.53 
 
 		 491 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  32.84 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.56 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  31.22 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  33.24 
 
 		 516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  32.95 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  32.95 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  32.95 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  32.95 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  32.95 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  32.59 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  32.66 
 
 		 489 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  29.02 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  29.86 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  28.31 
 
 		 418 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.72 
 
 		 587 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3957  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.26 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.67 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  36.07 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.11 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  34.72 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 671 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  30.18 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  36.08 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08530  efflux system component, RND family  37.23 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.62 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 530 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  35.05 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0996  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613489  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  28.38 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  27.67 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  25.42 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2804  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  34.72 
 
 		 330 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1081  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 468 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  35.98 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.139753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>