More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1078 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
459 aa  905    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  87.8 
 
 
456 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.06 
 
 
400 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  37.92 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  36.3 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  37.5 
 
 
418 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  37.13 
 
 
399 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  38.25 
 
 
423 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  37.06 
 
 
398 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.98 
 
 
427 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.54 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  34.04 
 
 
404 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  34.01 
 
 
520 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  35.15 
 
 
401 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  34.01 
 
 
520 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  32.9 
 
 
503 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  35.44 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 
404 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  34.3 
 
 
502 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  33.25 
 
 
407 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  33.07 
 
 
484 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  35.65 
 
 
484 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
416 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  34.06 
 
 
416 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
416 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
416 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  32.15 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  33.08 
 
 
416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  33.1 
 
 
456 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.64 
 
 
587 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  32.39 
 
 
400 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  36.92 
 
 
397 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 
538 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  32.87 
 
 
422 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  36.04 
 
 
488 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  35.76 
 
 
489 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 
491 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 
489 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  35.47 
 
 
489 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  34.77 
 
 
459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  30.59 
 
 
424 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 
421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  34.86 
 
 
484 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 
433 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  35.52 
 
 
489 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  35.52 
 
 
489 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  35.22 
 
 
489 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  35.22 
 
 
489 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  35.52 
 
 
516 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  35.22 
 
 
489 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  35.22 
 
 
489 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 
424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  33.62 
 
 
491 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  29.44 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  30.41 
 
 
537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.43 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  32.65 
 
 
504 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  34.38 
 
 
384 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  31.42 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  29.05 
 
 
410 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 
537 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 
451 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  29.85 
 
 
546 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  31.79 
 
 
383 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  29.09 
 
 
382 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 
362 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 
503 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.81 
 
 
519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.817622  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  30.28 
 
 
538 aa  136  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  29.94 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.4 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  30.64 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  30.6 
 
 
468 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.84 
 
 
404 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 
399 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.02 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  28.96 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 
537 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 
460 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 
420 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  31.31 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  31.74 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.41 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  31.92 
 
 
550 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.11 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  27.91 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  32.46 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  30.34 
 
 
379 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 
500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  29.89 
 
 
467 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 
359 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>